На биолого-химическом факультете института свыше 50 лет работает зоологический музей. Начало экспозиции положила коллекция, переданная в дар институту зоологическим музеем МГУ. В дальнейшем экспозиция пополнялась за счёт сборов в экспедициях кафедры и сборов студентов в период летней полевой практики, а также за счет поступлений чучел птиц и зверей из учколлекторов. В последние годы появились экспонаты, приобретенные за счет внебюджетных средств института. В настоящее время в экспозиции музея представлены большинство типов и классов современных животных. Музей располагает биогруппами, чучелами птиц и млекопитающих, наливными препаратами, коллекциями насекомых. Среди экспонатов музея, наряду с обычными, широко распространенными видами, представлены широко редкие виды, внесенные в Красные книги СССР, России и Московской области.

На базе музея проводятся занятия по зоологии, экологии и теории эволюции для студентов и школьников. Используется музей и при проведении биологических олимпиад и конкурсов.

В 2002 году за счет средств института в музее были проведены ремонт, реконструкция и перепланировка экспозиции. Появилась возможность более широкого использования уникальную коллекцию в зоологическом музее. В 2003 году музей был участником смотра музеев образовательных учреждений Московской области: Стал победителем и награжден дипломом в номинации «Естественнонаучные музеи».